Enero de 2118. La inspectora jefe del Departamento de Investigación Criminal, Akane Tsunemori, recibe un informe sobre un incidente en un navío extranjero: se ha hallado el cadáver de la profesora Milicia Stronskaya. Al reunirse con Shinya Kogami, un antiguo fugitivo del Departamento de Investigación Criminal, Akane se enfrenta a un caso que no tarda en superar sus expectativas. Los Papeles de Stronskaya podrían revelar una verdad que haría tambalearse al gobierno japonés, e incluso al Sistema Sibyl, hasta sus cimientos.

Él es un espía. Ella es una asesina. Juntos, Loid y Yor se guardan su doble vida para sí mismos mientras pretenden ser la familia perfecta. Sin embargo, su hija adoptiva Anya, una telépata, conoce apasionantes secretos de ambos sin que ellos lo sepan. Con el pretexto de llevar a su familia a una escapada de fin de semana invernal, el intento de Loid de avanzar en su misión actual, la Operación Strix, resulta difícil cuando Anya se involucra por error y desencadena eventos que amenazan la paz mundial.

Ha pasado un año desde los acontecimientos de SSSS.Gridman. El mundo está en paz y nadie, excepto Rikka y Utsumi, recuerda al kaiju, Gridman o Akane Shinjou. Esto incluye a Yuuta, quien a pesar de ser el anfitrión de Gridman, no recuerda los momentos más importantes de su vida. Entonces, cuando aparece un nuevo Kaiju, aprovecha la oportunidad para demostrarse a sí mismo que él también puede ser el héroe fusionándose con Gridman una vez más.

Catarina Claes es la hija del duque en un reino de fantasía. Después de caerse y golpearse la cabeza, Catarina recordó recuerdos de su vida anterior y se dio cuenta de que su vida actual es la de la villana de un juego romántico. Catarina entra en pánico al recordar que al final del juego, le sobrevendrá un destino terrible.

En un futuro ruinoso y tóxico, existe una comunidad en un gigantesco silo subterráneo que alcanza cientos de pisos de profundidad. Allí, las personas viven en una sociedad llena de normas que creen que están destinadas a protegerlas.