El virus mortal Medousa se extiende en forma de epidemia a escala mundial. Las autoridades deciden poner a un grupo de personas en sueño criogénico con la esperanza de que duerman hasta que sea hallada una cura. La adolescente Kasumi, una de los 160 elegidos, es sometida al proceso de criogenización en el Centro de Cápsulas e Sueño Frío en un antiguo castillo. Pero cuando Kasumi y los demás despiertan, se dan cuenta que el Centro no es como recordaban...

Después de doce años de jugar a su juego MMORPG favorito, Momonga inicia sesión por última vez y se encuentra transportado a su mundo para jugarlo indefinidamente. A lo largo de sus aventuras, su avatar asciende al título de Rey Hechicero Ains Ooal Gown. El Reino Sagrado, que alguna vez fue próspero pero ahora está al borde de la ruina, disfrutó de años de paz después de la construcción de un enorme muro que los protegía de las invasiones vecinas. Pero, un día, esto llega a su fin cuando el Emperador Demonio Jaldabaoth llega con un ejército de semihumanos malvados. Temiendo la invasión de sus propias tierras, el territorio vecino de la Teocracia Slane se ve obligado a rogar a sus enemigos en el Reino Hechicero por ayuda. Atendiendo al llamado, Momonga, ahora conocido como el Rey Hechicero Ains Ooal Gown, reúne al Reino Hechicero y su ejército de no muertos para unirse a la lucha junto con el Reino Sagrado y la Teocracia Slane con la esperanza de derrotar al Emperador Demonio.