"Qué fastidio". Esa era la frase favorita de Nagi Seishiro, estudiante de segundo año de preparatoria, en su día a día. Eso fue hasta que Mikage Reo, un compañero que soñaba con ganar la Copa del Mundo, descubrió la habilidad oculta de Nagi y le animó a jugar al fútbol y compartir su extraordinario talento. Un día recibe una invitación para el misterioso Proyecto BLUE LOCK. Allí se encuentra con los mejores delanteros del país. El sueño de Nagi de convertirse en el mejor junto a Reo le llevará a un mundo desconocido. Un prodigio sólo puede formarse cuando alguien lo descubre... ahora, el increíble talento y la personalidad del delantero Nagi Seishiro revolucionarán el mundo del fútbol.

Ha pasado un año desde los acontecimientos de SSSS.Gridman. El mundo está en paz y nadie, excepto Rikka y Utsumi, recuerda al kaiju, Gridman o Akane Shinjou. Esto incluye a Yuuta, quien a pesar de ser el anfitrión de Gridman, no recuerda los momentos más importantes de su vida. Entonces, cuando aparece un nuevo Kaiju, aprovecha la oportunidad para demostrarse a sí mismo que él también puede ser el héroe fusionándose con Gridman una vez más.